自然人控股和法人控股不同点如下：1、个体不同：自然人控股的有限公司一般是个人独资的，法人控股是一个组织。2、权利义务行使不同：法人股东行使权利，承担义务，需要通过具体人的行为来完成。这个具体的人往往是公司派出的股东代表，由公司出具授权委托书，委托股东代表公司来行使股东权利，履行股东义务；自然人控股不需要委托书。3、公司股东数量不同：自然人控股股东只有一个，法人控股的股东数量有多个。