工厂隔离期间有工资。根据我国法律的相关规定，工厂隔离期间在一个工资支付周期内的，应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资；超过一个工资支付周期的，但劳动者提供了正常劳动，支付给劳动者的工资不得低于当地的最低工资标准；劳动者没有提供正常劳动，企业应当发放生活费，生活费标准按各省、自治区、直辖市规定的办法执行。

公司罚款超过多少违法？
公司不管罚款多少都是违法的。公司作为用人单位不具有罚款的权利。针对公民实施罚款的主体仅限于有法律法规授权的行政机关、司法机关等，且罚款只能由法律、法规和行政规章进行设定，并严格依照法律所规定的程序进行。用人单位并不具备实施经济处罚权的主体资格，在公司的规章制度中设立处罚条款是无效的，依据该罚款条款对劳动者进行罚款，没有法律依据，所罚款金额应当予以返还。综上所述工厂隔离期间有工资。根据我国法律的相关规定，工厂隔离期间在一个工资支付周期内的，应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资；超过一个工资支付周期的，但劳动者提供了正常劳动，支付给劳动者相对应报酬，您清楚了吗？《工资支付暂行规定》第十二条非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。超过一个工资支付周期的，若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地的最低工资标准；若劳动者没有提供正常劳动，应按国家有关规定办理。