企业打井需要办理手续的。
要先办理取水许可证，首先到当地市水利局水政水资源管理办公室申请，经审查符合条件批准施工取水工程，若不符合条件告知不予批准。注意，各地对企业打井办理手续和要求均有不同，请以当地政策为准；
取水许可证是指利用水工程或者机械提水设施直接从江河、湖泊或者地下取水。一切取水单位和个人，都应当依照本办法申请取水许可证，并依照规定取水。
打水井怎样申报？
1、提出申请；到水利部门领取取水许可申请表；
2、勘查或调查；决定受理的，水利部门将派人到现场调查、勘查、核实与取水有关的情况和资料；
3、开工建设；获准钻井的，自批准之日起可兴建取水工程；
4、领取取水许可证；钻井工程竣工后，经验收合格，落实有关节水措施，即可到水利部门申领取水许可证，取得取水权利；
5、应当向所在地的县级以上水行政主管部门提出取水申请。
综上所述，企业打水井需要办理手续的，要先办理取水许可证。希望对您有所帮助。《中华人民共和国水污染防治法》 第三十八条 兴建地下工程设施或者进行地下勘探、采矿等活动，应当采取防护性措施，防止地下水污染。