旷工三天自动离职流程有以下情况：。
1、员工按照公司的规定自动办理离职手续，若是给用人单位造成损失的，用人单位可基于法律规定要求劳动者赔偿损失。。
2、用人单位方在确认员工未按规定履行请假手续而擅自离岗且无正当理由的，用人单位基于劳动者这一事实行为作出解除劳动合同的决定的，则需进行以下流程：。
（1） 应通过各种渠道联系员工上班，如准备通知信寄往员工的任何地址，保留签收证据，最好使用挂号信。。
（2）结清员工工资，并办理好社保手续。。
（3）保留好员工所有的档案及相关资料，如完备的考勤表。