主债务过了诉讼时效抵押权还是有效的。《物权法》第二百零二条规定：抵押权人应当在主债权诉讼时效期间行使抵押权;未行使的，人民法院不予保护。依据本条规定，过了主债权诉讼时效期间后，抵押权人丧失的是抵押权受人民法院保护的权利，即胜诉权，而抵押权本身并没有消灭，如果抵押人自愿履行担保义务的，抵押权人仍可以行使抵押权。