借款协议未按照手指指纹进行确认也同样具有法律效应。
这是因为在普通情况中，诸如借款协议等各类合同文件只需双方当事人签字确认便符合法律条例的要求，法律并未强制规定必须同时签署姓名和按下手指指纹。
在借款协议上有双方当事人的真迹签名就足以确保其有效性，由于对比手指指纹与字迹的鉴定更为科学专业，所以对于签名的真实性的认定相较于手指指纹更加准确可靠。
法律依据
《中华人民共和国民法典》第一百四十三条 【民事法律行为有效的条件】具备下列条件的民事法律行为有效：
(一)行为人具有相应的民事行为能力;
(二)意思表示真实;
(三)不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
《中华人民共和国民法典》第四百九十条 【合同成立时间】当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
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