在分居两年后，如果女方起诉男方离婚而男方不同意，这个问题可以通过法律途径来解决。首先，我们需要明确的是，分居两年是夫妻感情破裂的关键证据之一，也是法定的离婚情形之一。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。在法院审理离婚案件时，会进行调解，如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

　　针对这种情况，女方需要向法院提交分居两年的相关证据，以证明夫妻感情已经破裂。这些证据可以包括分居协议、房屋租赁合同、居委会或物业的证明、证人证言等。法院在审理时会全面考虑双方的感情基础、分居的原因以及分居期间所发生的各种状况。如果女方能够提供充足的证据证明分居的根本原因在于夫妻感情不和，并且经过调解也无法达成共识，那么法院通常会作出准予离婚的判决。

　　如果第一次起诉离婚法院没有判离，女方可以在判决书生效后的六个月后再次起诉。一般来说，第二次起诉离婚时，判决离婚的可能性会比较大。但具体的判决结果还是要根据每一个案件的实际情况来确定。

　　在这个过程中，女方需要坚定自己离婚的决心，积极收集各种证据，并配合法院的审理工作。同时，也要注意保护自己的合法权益，比如财产分割、子女抚养等问题。如果男方在分居期间有隐匿、转移财产的行为，女方可以向法院申请财产保全，以确保自己的财产权益不受损害。

　　总之，分居两年后女方起诉男方离婚而男方不同意的情况下，女方可以通过法律途径来解决。只要能够提供充足的证据证明夫妻感情已经破裂，并且符合法律规定的离婚情形，法院通常会作出准予离婚的判决。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条 【协议离婚】夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条 【诉讼离婚】夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解;如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
(一)重婚或者与他人同居;
(二)实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员;
(三)有赌博、吸毒等恶习屡教不改;
(四)因感情不和分居满二年;
(五)其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。