应届生两方协议不可以随便签。应届毕业生只签两方而不签三方合同，肯定是有影响的。
签三方合同的应届毕业生，毕业以后学校会把你的档案打回原籍  给你回原籍人事局的报到证；而只签两方合同的同学，学校就可能不给你盖章，你也就拿不到报到证，那么，你的档案就不能转往就业地，你也就不能在就职单位转正定级等。至于其他的待遇，诸如四险一金，也就没有了，将来的职称、出国、考公务员、晋职等等也就不用指望了。

法律依据

《中华人民共和国劳动法》规定 劳动者被用人单位录用后，双方可以在劳动合同中约定试用期，试用期应包括在劳动合同期限内。”这就是说，劳动合同是试用期存在的前提条件。不允许只签订试用期合同，而不签订劳动合同。这样签订的“试用期合同”是无效的。但“试用期合同”的无效，并不导致劳动法对劳动者的保护失效。