公民或组织不配合导致传染病传播流行，将可能面临相关行政、刑事和民事等三种法律责任。

行政责任方面，依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定，拒不执行人民政府在紧急状态情况下依法发布的决定、命令的，会被处以警告、罚款或拘留。  

刑事责任方面，对于不配合抗疫管理的行为，情节严重的，还可能构成妨害传染病防治罪、危害公共安全罪、妨害公务罪。

民事责任方面，单位和个人违反法律规定，可能会导致传染病传播、流行，给他人人身、财产造成损害的，应当依法承担民事责任。 

法律依据

《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十条 有下列行为之一的，处警告或者二百元以下罚款；情节严重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款： （一）拒不执行人民政府在紧急状态情况下依法发布的决定、命令的； （二）阻碍国家机关工作人员依法执行职务的； （三）阻碍执行紧急任务的消防车、救护车、工程抢险车、警车等车辆通行的； （四）强行冲闯公安机关设置的警戒带、警戒区的。 阻碍人民警察依法执行职务的，从重处罚。

《中华人民共和国传染病防治法》七十七 单位和个人违反本法规定，导致传染病传播、流行，给他人人身、财产造成损害的，应当依法承担民事责任。