抑郁症患者可以协议离婚。我国《婚姻登记条例》中所规定的不能离婚的情形是，协议离婚的当事人为无民事行为能力人或者限制民事行为能力人。因此类人并不能完全清楚地做出真实的意思表示，对婚姻解除的行为没有较为完整的认知能力。抑郁症虽属于精神疾病，但并不会导致患者部分或完全丧失辨认能力，患者对离婚的概念是可以清楚认知的。因此不影响协议离婚。

法律依据：

《婚姻登记条例》第十二条规定， 办理离婚登记的当事人有下列情形之一的，婚姻登记机关不予受理：

（一）未达成离婚协议的；

（二）属于无民事行为能力人或者限制民事行为能力人的；

（三）其结婚登记不是在中国内地办理的。