医师证丢了可以补办，但是首先要进行挂失，三个月之后到当地的卫生部门办理补办手续即可。

资格证丢失补办程序：

1、本人提出书面申请并在省级报刊上发丢失声明。

2、单位出具证明，县卫生局认可。

3、地市卫生局审核身份证、毕业证或职称证，提供考试报名表。（认定人员提供认定申请表）

4、省卫生厅补办，证书需注明补办日期。

执业证丢失补办程序：

1、本人提出书面申请并在市级报刊上发丢失声明。

2、单位出具证明，县卫生局认可。

3、地市卫生局审核身份证、毕业证、资格证。

4、地市卫生局补办，证书需注明补办日期。

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法律依据

《中华人民共和国执业医师法》第三十一条 受县级以上人民政府卫生行政部门委托的机构或者组织应当按照医师执业标准，对医师的业务水平、工作成绩和职业道德状况进行定期考核。
对医师的考核结果，考核机构应当报告准予注册的卫生行政部门备案。
对考核不合格的医师，县级以上人民政府卫生行政部门可以责令其暂停执业活动三个月至六个月，并接受培训和继续医学教育。暂停执业活动期满，再次进行考核，对考核合格的，允许其继续执业;对考核不合格的，由县级以上人民政府卫生行政部门注销注册，收回医师执业证书。