分居两年是不会自动离婚的，需要双方去办理离婚登记才可以。分居多久都不可能自动解除婚姻关系，必须办理离婚手续，双方同意达成协议的，可去民政局协议离婚，如果不能达成一致意见，一方可以向有管辖权的人民法院起诉离婚。因感情不和分居时间满两年的，一方起诉至法院要求离婚的，法院应当准予离婚。分居原因必须是因感情不和分居。分居满两年后，对方仍然不同意离婚的，但是符合法定离婚条件的，同时有证据证明因感情不和分居满两年的，即使对方坚持不肯离婚，法院也会判决离婚。

法律依据

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条 【协议离婚】夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。