农村建房占用林地的处罚是:由县级以上人民政府部门按照职责责令限期改正或者治理,可以并处罚款,故意毁坏耕地在5亩以上、非法占有农田以外的耕地在10亩以上的构成非法占有耕地罪,判处5年以下有期徒刑或者拘役,并处或者单处罚金。