劳动者在工厂厕所抽烟的行为,属于违反工厂相关的规章制度的,工厂可以依规章制度对劳动者进行处罚,但工厂不能因此而对劳动者进行罚款,如果工厂以罚款为由克扣劳动者工资的,工厂的行为违法,劳动者可以向劳动行政部门投诉处理。