加工贸易合同备案的优点主要是有利于保障合同的法律性,使合同有法律保障,不会有人篡改合同条款,减少当事人的合同风险。加工贸易合同备案是指加工贸易企业持合法的加工贸易合同到主管海关备案,申请保税并领取加工贸易登记手册或其他准予备案凭证的行为。