变造国家机关证件罪的立案标准：只要行为人实施了变造国家机关证件的行为，公安机关就应当立案追究行为人的刑事责任。变造国家机关证件罪，是指行为人非法变造、国家机关证件的行为，本罪侵犯的客体是国家机关的正常管理活动和信誉。
