劳动者擅自离职不需要支付违约金，但是擅自离职给用人单位造成损失的，应当进行赔偿。《劳动合同法》规定了两种情形下劳动者需要支付违约金，一是违反服务期的约定，二是违反了竞业限制的约定。
自动离职的员工也是有权拿工资的，不能够因自动离职的关系而不给员工发工资。 劳动合同依法签订即具有法律约束力，当事人必须履行劳动合同规定的义务。只要付出劳动，单位就要支付劳动报酬，虽然是自离，但单位应当与劳动者结算工资。 劳动者应当提前提出辞职并交接好工作，如果违反劳动法不辞而别给单位造成损失，则要承担赔偿责任。 根据劳动法的规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
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