单位实行综合工时制，如果劳资双方你情我愿且单位依法申请审批的，会生效。公司与劳动者关于实行综合计算工时工作制的约定不能违反法律的强制性规定。实行综合计算工时工作制有明确的行业限制，而且要求单位必须严格履行审批手续。
