申请农村房屋房产证,首先要申请宅基地使用权,然后向当地的街道办事处申请建设报批手续,竣工以后要去规划建设部门,申报竣工验收取得合格证明,然后携带相关材料向当地的房管所提出申请,房管所再进行审核和公告,最后登记发证。