抚养权是不能影响孩子的学区认定的。因为孩子在哪个学区上学主要是与户口有关的,与抚养权的归属等问题没有直接关系,抚养权归谁都可以办理入学,只需将孩子的户口办理好即可,孩子可以凭父母与子女的关系而就近入学。如果父母双方学区不同,在认为有需要的情况下,可以申请变更孩子抚养权并迁移户口,然后再户口迁入地就近办理入学。