人民检察院控告申诉检察部门管辖的刑事申诉案件有: 1、不服检察院不批准逮捕决定的申诉; 2、不服检察院不起诉决定的申诉; 3、不服检察院撤销案件决定的申诉; 4、不服法院已执行完毕的刑事判决、裁定的申诉以及被害人不服法院已经发生法律效力且尚在执行中的刑事判决、裁定的申诉。