查封车是否扣押机动车需要按案件情况而定,如果只是单纯查封,只是查封了车辆的档案,此时车主是可以继续使用汽车的,只是不能转移,变更它的所有权。另外,案件还没完结,并且车主继续使用对该财产价值无重大影响的,法院是不会暂扣机动车的。如果案件判决了就有可能出现强制执行的情况的,强制执行就会扣押机动车并强制拍卖该车辆。