法院不能直接退回公安机关补充侦查。如果检察院不主动申请撤回,那么法院只能依法作出证据不足,起诉的犯罪不能成立的无罪判决。除非是在一审判决作出前,提起公诉的检察院向法院申请撤回起诉进行补充侦查经法院裁定准许后才可以,检察院不主动申请,法院是不能决定退回的。