土地承包经营权纠纷双方当事人可以先行协商解决；协商不能达成一致的当事人可以通过调解解决纠纷；当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁；对仲裁结果不服的可以向人民法院提起诉讼。
土地承包经营权转让流程是： 1、发包方对承包方提出的转包、出租、互换或者其他方式流转承包土地的要求，应当及时办理备案，并报告乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门。 2、承包方转让承包土地，发包方同意转让的，应当及时向乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门报告，并配合办理有关变更手续； 发包方不同意转让的，应当于七日内向承包方书面说明理由。 3、乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门应当及时向达成流转意向的承包方提供统一文本格式的流转合同，并指导签订。 4、乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门应当建立农村土地承包经营权流转情况登记册，及时准确记载农村土地承包经营权流转情况。
农村土地承包经营权证发包人是不可以用的，只有承包人才能用，但发包人可以对承包人使用土地情况进行监督。 发包方享有下列权利： （一）发包本集体所有的或者国家所有依法由本集体使用的农村土地； （二）监督承包方依照承包合同约定的用途合理利用和保护土地； （三）制止承包方损害承包地和农业资源的行为； （四）法律、行政法规规定的其他权利。 农村土地承包经营权证的作用有： （一）农村土地承包经营权证是农村土地承包合同生效后，国家依法确认承包方享有土地承包经营权的法律凭证。 （二）农村土地承包经营权证有利于进一步稳定和完善农村土地承包关系； （三）农村土地承包经营权证能解决农村的土地承包原始数据和资
可以补办农村土地承包经营权证。 农村土地承包经营权证严重污损、毁坏、遗失的，承包方应向乡（镇）人民政府农村经营管理部门申请换发、补发。经乡（镇）人民政府农村经营管理部门审核后，报请原发证机关办理换发、补发手续。 由此可知，土地承包经营权证丢失的，承包方需向相关部门提出申请，经审核后，报原发证机关，由原发证机关向提出申请的承包人补发土地承包经营权证。
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