一、根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条的规定，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。 二、农村宅基地面积大小并没有统一的标准，因为各个省份的民情不一样，土地资源丰富程度、人口数量等情况都不相同，所以各地制定宅基地面积所根据的标准也是不一样的。
1、退还超出部分的面积 对于农村宅基地面积超标的农户而言，若是不希望自家被罚款，在宅基地却确权之前，可以将超出的宅基地面积退还给本村集体。 2、超出部分有偿使用 部分地区在试行宅基地有偿使用的政策，当自家宅基地不合法超标时，可以按照宅基地有偿使用的政策要求和标准，去相关部门缴纳一定的费用，至于缴纳费用具体是多少还得视情况而定，一般是超出的面积越多，其需要缴纳的费用自然也会更多。 3、强制收回 （1）其实对于农村宅基地面积超标的处理情况很少有强制收回的情况，但是也部分情况下是会进行强制拆除的，比如建新房却未拆除旧房，强制占有的宅基地，用欺骗手段获得的宅基地等等情况。 （2）此外，对于那些已将农村户口注销的，但是农村宅基地还存在但无人居住的，也无人继承的农村宅基地，将会被村集体无条件收回。 4、暂时保留 （1）部分农村宅基地超标其实是不适合拆除的，这时可以通过村集体组织成员的集体会议进行讨论，一般会给予暂时保留的处理方法。 （2）这种暂时保留的处理方式，主要是针对这几种宅基地面积超标的情况，比如拆除后会影响相邻居住人员的居住安全，将予以暂时保留，或者是将这栋拆除后，会影响村集体的公共利益，那么该房屋也将暂时保留。
具体情况具体分析。对于农村建房超面积罚多少，具体应根据宅基地的面积标准以及当地政府根据当地的土地资源情况、民生民情以及人口的数量来确定，处罚收费标准如下：1.对于农村建房面积超出20平方米以下的部分，将不收取任何处罚费用。2.对于农村建房面积超出20-70平方米的部分，按每年3元/平方的标准费用收取。3.对于农村建房面积超出标准面积的，每增加50平方米，都将按照在收费标准上提高3元/平方进行计算。4.若房屋的总面积严重超出标准范围之内的，政府有权利将多出的宅基地面积执行回收处理。
申请农村房屋房产证，首先要申请宅基地使用权，然后向当地的街道办事处申请建设报批手续，竣工以后要去规划建设部门，申报竣工验收取得合格证明，然后携带相关材料向当地的房管所提出申请，房管所再进行审核和公告，最后登记发证。
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