非法运输弹药罪有以下惩罚: 1、犯非法运输弹药罪的,一般处三年以上十年以下有期徒刑; 2、属于情节严重情形的,处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑; 3、如果单位犯本罪的,应对单位惩处罚金,并对其直接责任人员依照个人犯罪的规定进行处罚。