离婚共同购买的商铺按以下方式进行分割：
1、一方愿意经营另一方不愿经营的，由双方协商商铺价格，协商不成的由相关评估部门对商铺作价评估，再以合理的价格给予未取得经营权一方经济补偿。
2、双方都要经营商铺的，由人民法院根据双方实际情况，考虑个人经济情况、有利于商铺经营的原则予以判决，双方条件相当的，由人民法院组织竞价，价高者得。取得经营权的一方给与对方一定的经济补偿。
3、双方均不愿意经营商铺的，由双方共同协商申请转让或者拍卖后，所得价款再按夫妻共同财产进行分割。
《婚姻法》第三十九条，离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成时，由人民法院根据财产的具体情况，照顾子女和女方权益的原则判决。
夫或妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。