如果是境内自然人,而且没有享受个人所得税减免税优惠的话;那么在申请代开增值税普通发票时需要代扣代缴1.5%的个人所得税。个人申请开普通发票,依照税收法律、行政法规规定应当缴纳税款的,应当先缴纳税款,再代开发票.个人应缴纳的增值税,由国税机关征收;个人应缴纳的城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加,由国税机关代征.
自然人开普通发票的方法有哪些？
（1）携带购买方的信息，以及个人信息，去所在地的税务局；
（2）在税务大厅领号，到号之后，在柜台办理业务，填制表格，交给工作人员，缴纳税费就可以开具发票了。
综上所述，自然人开普通发票依照税收法律、行政法规规定应当缴纳税款的。希望以上回答对您有所帮助。