医保卡一般是直接去银行办理的，新生儿医保卡也是一样。只要携带相关的资料，前往银行柜台办理医保卡并缴纳保费，通常当场就可以办下来。而如果申请的是社保卡，那么会需要1-2个月的制卡时间，这样一来时间就比较长。拿到医保卡以后去当地的医保部门登记，这样医保卡在激活后就可以正常使用了。
医保卡通常是作为临时卡使用的，以后如果办理了社保卡，那么医保卡就可以作废了。
什么时候办理合适
宝宝医保卡，最好在出生三个月之内办理。因为好多地方都有为婴儿开通“绿色通道”，在宝宝出生三个月内办理医保卡，享受医保待遇就从出生之日开始算起（也就是宝宝出生时的各项体检费凭借发票都能报销）。三个月到一岁以内办理，医保权益从办理次月开始享受。如果超过一岁才办理，要等第二年1月1日才能享受医保待遇。
缴费和报销问题
办理新生儿医保卡之后，个人缴纳一部分费用，财政补助一部费用（不同地区缴费标准不同，以广州市为例，新生儿医保每年个人缴费80元，政府补贴200元）。不论宝宝看病还是住院，都可以按照一定比例进行报销。报销比例根据医院等级，一、二、三级医院分别为80%、70%、60%（不同城市有区别）。
《社会保险法》
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。