根据我国法律的有关规定，若双方签订的建设工程施工合同有效，对保证金期限有约定的，按照约定时间履行。若合同中没有约定、或者建设工程建工合同无效，则保证金应该在建设工程通过竣工验收之日起满二年返还。若因发包人的原因导致建设工程未按约定期限进行竣工验收的，工程质量保证期限自承包人提交工程竣工验收报告九十日开始计算。

工程保证金比例是多少？
1、工程质量保证金总预留比例不得高于工程价款结算总额的3%。合同约定由承包人以银行保函替代预留保证金的，保函金额不得高于工程价款结算总额的3%。综上所述工程质量保证金期限已合同中约定的为主。希望对您的问题有所帮助。《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（二）》第八条：
有下列情形之一，承包人请求发包人返还工程质量保证金的，人民法院应予支持：
(一)当事人约定的工程质量保证金返还期限届满。
(二)当事人未约定工程质量保证金返还期限的，自建设工程通过竣工验收之日起满二年。
(三)因发包人原因建设工程未按约定期限进行竣工验收的，自承包人提交工程竣工验收报告九十日后起当事人约定的工程质量保证金返还期限届满；当事人未约定工程质量保证金返还期限的，自承包人提交工程竣工验收报告九十日后起满二年。
发包人返还工程质量保证金后，不影响承包人根据合同约定或者法律规定履行工程保修义务。