当事人的房屋被有关部门认定为违法建筑的，当事人可以申请行政复议或者提起行政诉讼的方式维权。
申请人申请行政复议，可以书面申请，也可以口头申请口头申请的，行政复议机关应当当场记录申请人的基本情况、行政复议请求、申请行政复议的主要事实、理由和时间。
起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，出具注明日期的书面凭证，并告知对方当事人。