1、两者性质不同。开除属于《公务员法》规定的行政处分当中的最高处分，分别为：警告、记过、记大过、降级、撤职、开除。其中给予开除处分的，应当报上级机关备案。而辞退则是指机关依照法律、法规规定，解除与公务员的任用关系。被辞退的公务员仅是有不适合继续留任的情形，被辞退后，可以领取辞退费或者根据国家有关规定享受失业保险。
2、两者的后果。不同被开除的公务员一般需要同时承担相应法律责任，且终身不能再成为公务员。被辞退的公务员则没有这么严重的后果，根据公务员招录考试要求的不同，一般禁考3-5年。