公司三个月不发工资不能直接起诉。但是对于拖欠劳动报酬的案件,劳动者可以直接向法院申请支付令。根据《劳动法》79条的规定，法律规定劳动纠纷适用仲裁前置程序。当事人需要先向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁不服的，可以向人民法院提起诉讼。《劳动合同法》第30条规定：用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬的,劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令,人民法院应当依法发出支付令。