专项附加扣除不是从工资里扣，专项附加扣除指的是，在计算综合所得应纳税额时，除了5000起征点和“三险一金”等专项扣除外，还允许额外扣除的项目，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金，以及赡养老人等专项附加扣除等六项费用。
专项附加扣除将于明年1月1日起施行，折算到月收入的个税计算方式如下：
月度收入-5000元起征点-专项扣除三险一金等-专项附加扣除-依法确定的其他扣除=应纳税所得额。
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根据最新《中华人民共和国个人所得税法》的规定，工资薪金所得属于综合所得，个人自1月1日及之后取得综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额。