两者之间在印制、使用主体、内容、联次和发票作用都有所不同。

发票的印制方面:两者的要求不同：增值税专用发票由国务院税务主管部门指定的企业印制；普通发票，分别由省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局指定的企业印制。

发票使用的主体方面：增值税专用发票一般只能由增值税一般纳税人领购使用；普通发票则可以由从事经营活动并办理了税务登记的各种纳税人领购使用。

发票的内容方面：增值税专用发票比普通发票要多纳税人税务登记号、不含增值税金额、适用税率、应纳增值税额等内容。

发票的联次方面：增值税专用发票有四个联次和七个联次两种；普通发票则只有三联。

发票的作用方面：增值税专用发票除了做购销双方收付款的凭证，还作购买方扣除增值税的凭证；而普通发票一般不予作抵扣用。

【法律依据】

《中华人民共和国增值税暂行条例》

第一条 在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务(以下简称劳务)，销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。