通过扣缴义务人申报和综合所得年度自行申报区别区别在于：通过扣缴义务人申报的，意味着通过公司来代扣，适合上班族，选择这项后单位会获得你的申报信息，帮你申报帮你代扣，年终不需要再进行核算和申报，对于上班族来说比较省事。综合所得指的是工资薪金所得、劳务费收入所得、稿酬所得、特许权使用费所得四项收入合一的综合收入，这种方式预扣预缴的税率非常高。