法院对于小产权房在执行时一般不会强行拍卖。不过，在这类财产仍有使用价值的情况下，也就是说房东有收租的权利时，法院可以针对这部分进行拍卖。

即小产权房只有使用权，没有所有权。但小产权房又有使用价值，所以有的法院对小产权房的使用权进行处理，也不违法。

【法律依据】：

《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第二条：

人民法院可以查封、扣押、冻结被执行人占有的动产、登记在被执行人名下的不动产、特定动产及其他财产权。 
未登记的建筑物和土地使用权，依据土地使用权的审批文件和其他相关证据确定权属。 
对于第三人占有的动产或者登记在第三人名下的不动产、特定动产及其他财产权，第三人书面确认该财产属于被执行人的，人民法院可以查封、扣押、冻结。