民事诉讼结案后不会有案底，但是法院会对民事纠纷案件存档。这里的案件存档并不是案底。

案底是指某人过去犯法或犯罪行为的记录。又称犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门保存。

【法律依据】