员工入职体检不合格，首先就是要查明原因，再对症下药。可以在医生的建议下进行治疗或是请求复检。复检结果扔不符合用人单位要求的，用人单位对于此员工不予录用。

《公务员录用规定》第二十七条规定，体检工作由设区的市级以上公务员主管部门负责组织，招录机关实施。 体检的项目和标准依照国家统一规定执行。

体检应当在设区的市级以上公务员主管部门指定的医疗机构进行。

体检完毕，主检医生应当审核体检结果并签名，医疗机构加盖公章。

招录机关或者报考者对体检结果有疑问的，可以按照规定提出复检。

必要时，设区的市级以上公务员主管部门可以要求体检对象复检。