土地使用权证丢失后可以向土地管理部门申请补办，由本人向当地的土地管理部门挂失，提交相关证明文件资料并经审查通过后给予补办土地使用证。

【法律依据】

《中华人民共和国土地管理法实施条例》第五条，单位和个人依法使用的国有土地，由土地使用者向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级以上人民政府登记造册，核发国有土地使用权证书，确认使用权。其中，中央国家机关使用的国有土地的登记发证，由国务院土地行政主管部门负责，具体登记发证办法由国务院土地行政主管部门会同国务院机关事务管局等有关部门制定。未确定使用权的国有土地，由县级以上人民政府登记造册，负责保护管理。