工程债权债务确认流程：

1、与业主在办理工程价款结算过程中形成的应收账款和预收账款，各单位财务部门要建立台账进行记录和反映。

2、预付账款必须按照规定程序办理。

3、合同部门应及时办理分包结算，材料部门及时持发票报销。

4、各种债权债务要明确责任人员，原则上经办人为主要责任人，部门主管要督促经办人及时办理清算工作。

5、各单位主管要定期过问本单位的债权债务情况，财务部门对于时间较长的应收、应付款要及时向有关领导汇报，由有关领导组织力量或责成有关责任人进行清收。

6、各单位要建立债权债务的核对签认制度。

7、支付各种债务时，收款（债权）单位经办人要出具有效证明其与收款（债权）单位关系的证明材料和盖有收款（债权）单位财务专用章的正式收据，收据上的收款（债权）单位名称应与我单位账面上反映的债务单位名称一致，并经有关单位领导签字后财务部门方可办理支付。

【法律依据】

《合同法》第六十七条，当事人互负债务，有先后履行顺序，先履行一方未履行的，后履行一方有权拒绝其履行要求。先履行一方履行债务不符合约定的，后履行一方有权拒绝其相应的履行要求。