商标权纠纷的具体情况不同，管辖法院也是不同的。

（1）侵犯商标专用权案件一般由侵权行为地或者被告住所地的中级人民法院或者有商标案件管辖权的基层法院管辖。

（2）商标合同纠纷案件。合同的双方当事人可以在书面合同中协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。

当事人约定的履行地与实际履行地不一致的，以实际履行地为准。因此，上述地点的中级人民法院或者有商标案件管辖权的基层人民法院有管辖权。

（3）商标权属纠纷案件：由被告住所地的中级人民法院或者被告住所地有商标案件管辖权的基层人民法院管辖。

法律依据：《民事诉讼法》第二十八条：因侵权行为提起的诉讼，由侵权行为地或者被告住所地人民法院管辖。