夫妻分居两年并不会自动离婚，离婚须经过合法的程序。

我国法律规定的分居两年是指：因为感情不和分居满两年。这是法院认定感情破裂可以判决离婚的法定条件，不过要注意，这句话里要注意三个问题：

第一、必须是因为感情不和分开的，不能是因为工作原因等分居的；

第二、分居的标准，通常是在不同地点的两处房屋内各自分开居住，如果只是分床或分房睡，并不是严格意义上的分居；

第三、分居的两年，必须是持续性的，如果是断断续续的分居，则要从最后一次分居时间计算两年。

【法律依据】《婚姻法》第三十二条： 夫妻因感情不和分居满二年的，调解无效的，应准予离婚。