机动车违章停车是会扣分的，而且根据违章情节的不同，扣分标准也有所不同，具体如下：

1、驾驶营运客车在高速公路车道内停车的，一次记12分；

2、驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车的，一次记6分；

3、驾驶机动车行经交叉路口不按规定行车或者停车的，一次记2分；等等。

【法律依据】

《道路交通安全违法行为记分分值》第一条第八项规定，机动车驾驶人驾驶营运客车在高速公路车道内停车的，一次记12分。