如何清理债权债务企业：1、重新审核签订偿还协议，并按协议约定清缴欠款。2、债权清缴与财政扶持和抹帐等相结合、实施综合清欠。3、鼓励企业发展，对成长性较强的生产型企业欠款，采取债权转股权或债权转投资，并依据中华人民共和国公司法、中华人民共和国合同法等法律、法规的有关规定，履行相关手续。

【法律依据】

《公司法》第一百七十四条，公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。