收取加盟费与商标没有关系，只要是选择加盟的就必须要给加盟费，但是有了商标之后还会涉及到产权保护费。

【法律依据】

《商业特许经营管理条例》第九条，商务主管部门应当自收到特许人提交的符合本条例第八条规定的文件、资料之日起10日内予以备案，并通知特许人。特许人提交的文件、资料不完备的，商务主管部门可以要求其在7日内补充提交文件、资料。