男女双方之间没有结婚证但有孩子是不是婚姻关系需要区别对待。在1994年2月1日之前男女双方均符合婚姻法规定的结婚实质要件，并且共同生活的，属于事实婚姻。如果双方要离婚，需要通过法院起诉解除婚姻关系。事实婚姻不能协议离婚，只能通过法院起诉离婚。法院经审理查明双方感情的确破裂，及时作出准予双方离婚的判决书。
《中华人民共和国婚姻法》
最高人民法院关于适用《中华人民共和国婚姻法》若干问题的解释（一）
第五条未按婚姻法第八条规定办理结婚登记而以夫妻名义共同生活的男女，起诉到人民法院要求离婚的，应当区别对待：
1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以前，男女双方已经符合结婚实质要件的，按事实婚姻处理
1994年2月1日民政部《婚姻登记管理条例》公布实施以后，男女双方符合结婚实质要件的，人民法院应当告知其在案件受理前补办结婚登记未补办结婚登记的，按解除同居关系处理。