股东名册登记的办理流程如下：
1、确认股东认购的股权；
2、公司签发股权证明书；
3、到工商行政部门办理相关的出资登记。
依照《公司法》第三十二条规定，有限责任公司应当置备股东名册，记载下列事项:
（1）股东的姓名或者名称及住所；
（2）股东的出资额；
（3）出资证明书编号。
记载于股东名册的股东，可以依股东名册主张行使股东权利。公司应当将股东的姓名或者名称向公司登记机关登记;登记事项发生变更的，应当办理变更登记。未经登记或者变更登记的，不得对抗第三人。