划定自然保护区后，原居民不同意搬迁的，不能直接强占农民的土地，但可以通过合法的途径强制征收土地。
土地在征收的过程中，可以采取强制执行措施，但需要向人民法院申请，人民法院批准后，才能采取强制措施。
强制征地的流程有：
（一）农用地转用、征用土地，必须符合土地利用总体规划、城市建设总体规划和土地利用年度计划。因此，用地单位在初步选定某农用地为建设用地后，应首先向国土资源局、建设部门、规划部门咨询是否符合该农用地的各项规划。
（二）确认该农用地可以用于建设，再根据建设部门的要求，进行和编制建设项目可行性论证，向建设部门提交用地申请，建设部门审查符合的，颁发建设项目的《选址意见书》。用地单位应按规定缴纳选址规费。
（三）用地单位持该《选址意见书》向同级国土资源局提出用地预审申请，由该国土资源局核发《建设项目用地预审报告书》。
（四）用地单位凭《建设项目用地预审报告书》向建设部门、环保局等办理立项、规划、环保许可等手续，并缴纳各项审批费用。
（五）用地单位再持以上审批文件，向原预审的国土资源局提出项目用地的正式申请。
房屋被划到自然保护区内拆迁的补偿如下：
1、房屋补偿费，以被拆迁房屋的结构和折旧程度划档，按平方米单价计算；
2、周转补偿费，以临时居住条件划档，按被拆迁房屋住户的人口每月予以补贴；
3、奖励性补偿费，由当地人民政府根据本地的实际情况和国家有关法律政策加以确定。

法律依据

《《中华人民共和国自然区保护条例》》第二十七条 禁止任何人进入自然保护区的核心区。因科学研究的需要，必须进入核心区从事科学研究观测、调查活动的，应当事先向自然保护区管理机构提交申请和活动计划，并经自然保护区管理机构批准;其中，进入国家级自然保护区核心区的，应当经省、自治区、直辖市人民政府有关自然保护区行政主管部门批准。 自然保护区核心区内原有居民确有必要迁出的，由自然保护区所在地的地方人民政府予以妥善安置。