当事人对行政处罚部分，申请复议后仍然部分，提起行政诉讼的，要做到以下几点。
1，确定管辖的法院。
当事人可以到最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院起诉，也可以由复议机关所在地人民法院起诉。
2，确定被告比较复杂。
（1）经复议的案件，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关是共同被告；
（2）复议机关改变原行政行为的，复议机关是被告。
（3）复议机关在法定期限内未作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关是被告；
（4）起诉复议机关不作为的，复议机关是被告。
（5）两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的行政机关是共同被告。
（6）行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。
（7）行政机关被撤销或者职权变更的，继续行使其职权的行政机关是被告。
3，到相应的法院起诉即可。

法律依据

《行政诉讼法》第十八条 行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖。经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民法院管辖。
经最高人民法院批准，高级人民法院可以根据审判工作的实际情况，确定若干人民法院跨行政区域管辖行政案件。

《行政诉讼法》第二十六条 公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，作出行政行为的行政机关是被告。
经复议的案件，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关是共同被告;复议机关改变原行政行为的，复议机关是被告。
复议机关在法定期限内未作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关是被告;起诉复议机关不作为的，复议机关是被告。
两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的行政机关是共同被告。
行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。
行政机关被撤销或者职权变更的，继续行使其职权的行政机关是被告。